Можливостей для діяльності Меджлісу кримськотатарського народу в Криму зараз набагато менше, ніж до анексії півострова Росією. Голова Меджлісу Рефат Чубаров заявив на прес-конференції в Києві 30 грудня, що найбільш важливі напрямки діяльності перенесені на материкову Україну.
За його словами, це, зокрема, зовнішньополітична діяльність і зв'язки з діаспорою.
«Наші можливості в окупованому Криму набагато менші, ніж раніше. Не все ми можемо робити власне на кримській землі, тим більше, що частина членів Меджлісу – 8 з 33-х – уже не можуть перебувати в Криму. Деяким, як мені, заборонений в'їзд до Криму, проти деяких відкрито кримінальні справи», – розповів він.
Чубаров зазначив, що «переважна більшість» регіональних меджлісів у Криму залишились вірними принципам кримськотатарського національного руху.
Після анексії Криму Росією на початку 2014 року лідерам кримських татар Рефата Чубарова, Мустафи Джемілєва російська влада заборонила в'їзд на півострів на п'ять років.
23 жовтня 2015 року Громадська палата Російської Федерації звернулась до генпрокурора Росії з проханням перевірити на предмет екстремізму діяльність Меджлісу кримськотатарського народу. Однією з причин такого звернення стала «торгова» блокада Криму з боку Херсонської області, ініційована лідерами кримських татар. Російський прокурор Криму Наталія Поклонська також заявила про те, що допускає визнання Меджлісу «екстремістською організацією» і подальшу заборону його діяльності.