Мустафа Джемилев получил уважение своего народа и статус национального лидера благодаря несгибаемой позиции в борьбе за права крымскотатарского народа. На протяжении 1966-1983 годов он был шесть раз арестован. Имел семь судимостей, провел в заключении 15 лет за «распространение взглядов, порочащих советский строй». В 1975-1976 годах провел 303-дневную голодовку в Омской тюрьме. На свободу вышел в 1986-ом году.
С 1991 по 2013 год был главой Меджлиса крымскотатарского народа. Мустафа Джемилев – народный депутат III-VІІ созывов Верховной Рады Украины. С ноября 2014 года – народный депутат Украины VIII созыва. На протяжении всех каденций в украинском парламенте оставался беспартийным.
20 августа 2014 года указом украинского президента Петра Порошенко №657/2014 назначен уполномоченным президента Украины по делам крымскотатарского народа.